Управление Федерального казначейства по г. Москве было создано 03.06.1997. С 04.06.2018 по настоящее время Управление возглавляет А.И. Лукашов - советник государственной гражданской службы Российской Федерации 1 класса, кандидат экономических наук, доцент по кафедре экономики.